單細胞空間轉錄組數據分析可視化平臺 目前， 8種空間轉錄組技術，這些數據來自5個物種，包括人類、小鼠、果蠅、秀麗隱桿蟲線和斑馬魚。研究團隊針對這些數據集進行了整合中統計描述的轉錄組技術研究團隊從論文中提取了每種技術的簡要說明和示意圖，并研讀了每個數據集的原始論文，提取相應的元數據，包括出版信息、數據描述、實驗設計、樣本和數據可用性等。單細胞空間轉錄組于數據集中來自不同組織、處理方法的樣本或生物技術復制品，研究團隊將其手動劃分為305個子數據集。所有收集的數據集和研究結果均有文章發表?？捎糜诳梢暬捅容^空間分辨下的轉錄組數據。該數據庫提供的空間差異表達基因及豐富的功能注釋，有助于進一步數據分析。組織細胞的空間結構提供了一個資源庫，并為了解疾病中的細胞微環境帶來新的見解。目前，空間轉錄組可從獲得，無需注冊或登錄。人類細胞圖譜計劃的主要目標之一是表征所有細胞類型的空間關系，同時基于表達特征在空間上映射多種細胞類型可能的相互作用。空間轉錄組技術重點為特殊的載玻片。河北歐易生物空間轉錄組規格

用新的角度重新說明下空間信息的價值。當下是存在很多機會的，可以通過計算技術將空間信息和scRNA-seq結合起來，再將單細胞映射回空間，這樣構建和使用參考圖譜。這個對從原位雜交或不使用以前圖譜重建空間圖譜的計算方法很感興趣。換一種方式說明，novoSpaRc，在沒有參考圖譜的情況下進行“基因表達繪制圖譜”。它基于關于基因表達如何在組織切片中變化的假設。vanOudenaarden說，擁有更多關于組織的數據是一筆財富，這筆財富使得了解重要的“骨骼”（生物學的關鍵方面）成為“一個更大的難題”。這是一種新的方式，單細胞組學和空間方法的結合“確實是一種產生無限可能的方式，當然還需要使用單獨收集的數據來確認和驗證發現。 河北歐易生物空間轉錄組規格空間轉錄組的組學板塊包括cDNA的合成、擴增、接頭連接和測序，記錄切片的轉錄本信息和空間位置信息 。

單細胞轉錄組RNA測序（scRNA-seq）技術的出現促進了現代細胞和分子生物學的發展。scRNA-seq可以覆蓋大量RNA-seq數據中的細胞子集，并提供每個單細胞的轉錄組信息，揭示細胞間的異質性。單細胞空間轉錄組技術，但是當scRNA-seq應用于組織時，會丟失至關重要的空間信息。而單細胞空間轉錄組技術可以同時進行單細胞轉錄組測序并記錄組織細胞的空間位置信息，在神經科學、發育生物學、免疫學等研究領域都有重要應用。隨著檢測空間基因表達模式方法的不斷出現，空間轉錄組數據正在迅速積累。由于方法的多樣性和數據分析的復雜性，該領域尚缺乏一個可方便整合、比較和可視化空間轉錄組數據的數據庫。為解決這一問題，歐易生物技術團隊開發了針對空間轉錄組技術和數據集的數據庫，可供研究人員有效使用已發布的空間轉錄組數據。

空間轉錄組數據分析的重要是根據每個芯片上每個spot的基因表達信息進行聚類，然后將spot根據坐標位置序列放回到組織的圖像上，同時可以對每個gene在組織上表達的空間位置進行定位。獲得測序數據后，首先利用Space Ranger 軟件可以自動化的對圖像進行處理、數據比對和Barcode處理。另外一個軟件Loupe Cell Browser是一個適用于Windows和MacOS的桌面應用程序，它可以快速、輕松地可視化和分析10X Visium數據。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。除大腦以外的其他***的技術現代化，將為開發有用的空間轉錄組學地圖集提供廣闊的前景。

美國腦計劃啟動的 BICCN 項目，該項目將整合不同類型細胞的分子、解剖學和生理學特性，創建小鼠腦細胞 3D 參考圖譜，同時也將基于人類和非人類靈長類腦組織樣本，繪制腦細胞參考圖譜 ，其涉及空間轉錄組學技術主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些實現空間轉錄組學的重要技術，可以追溯到二十世紀七十年代，長期以來，各種形式的原位雜交技術（ISH）已用于可視化空間中的基因表達。從技術原理中不難看出，空間轉錄組技術重要為特殊的載玻片。10X Genomics 繼單細胞測序后也推出了空間轉錄組測序技術。河北歐易生物空間轉錄組規格

scRNA-seq 技術的進步啟發了利用高分辨率轉錄組定量分析與空間轉錄組學數據的互補性質的新方法。河北歐易生物空間轉錄組規格

單細胞轉錄組測序技術的如火如荼，伴隨著空間轉錄組測序技術的蓬勃發展，可以看到，在現有的高通量檢測技術領域，這兩種技術已為科學研究的發展提供了前所未有的技術支撐。從2019年單細胞多組學被評為《Nature Methods》年度技術進展，到2020年空間轉錄組技術也被評為年度技術進展，相信在接下來的時間里，單細胞轉錄組和空間轉錄組將為生命科學的發展做出極其重要的貢獻。單細胞轉錄組測序技術的特點在于提供詳實的每個細胞的轉錄表達信息，但是缺失了來源組織的空間組成信息?，F有商用空間轉錄組測序技術的特點在于提供了完整的組織空間位置信息，但是每個捕獲spot的信息無法達到單細胞分辨率（10個左右細胞）。因此，這兩個技術的存在是天然互補的，而將兩者的結合也是水到渠成，完美結合。河北歐易生物空間轉錄組規格

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