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空間轉錄組測序的數據質量和玻片有效區域的利用率、貼片的質量和透化時間息息相關。貼片質量不良會影響總的有效spot數等;而透化不合理會導致spot的reads數、基因中位數等參數。而 在特異性基因表達方面,我們也可以統計空間轉錄組群體的特異性基因表達即Markergene,將他們在組織切片以及空轉上進行著色。我們也可以對于任意一個已知的基因或者數據庫中的一些細胞Marker,然后將其在基因表達在空間轉錄組的切片以及HE染色上展示自己的基因表達進而了解,群體中的可能的細胞組成關系。 烈冰測序數據分析平臺,不依賴已有物種信息,可研究非模式物種,針對不同平臺的數據,制定多套流程;廣州單細胞BCR測序數據分析
烈冰科技作為國內同時擁有10X Genomics和BD Rhapsody雙分選平臺的測序服務商及云計算服務供應商,經過多年實戰,擁有豐富的單細胞懸液制備和分選經驗,實測BD Rhapsody對能夠高效捕獲粒細胞。針對不同的分選平臺、建庫方法,實戰總結搭建出不同的數據預處理工作流程;烈冰科技NovelBrain?生物大數據平臺能有效支撐生命科學研究、醫療健康等領域對大數據分析的需求。完備的高通量測序實驗平臺,包括NovaSeq 6000、10X Chromium X、BD FACSMelody、PANNORAMIC數字切片掃描儀等,配合一支來自海內外名校、多學科交叉型的高素質綜合團隊,為您的科學研究保駕護航。廣州單細胞BCR測序數據分析單細胞測序數據分析,認準烈冰NovelBrain生物信息數據分析平臺。
多樣本數據合并:Fraction of Reads Kept:合并樣本時,各樣本根據Mapped Barcoded Reads per Cell數量計算出來的數據利用率。如果各樣本間該參數值相差很大,需要進行Downsample處理,以數據量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測序深度標化到同一水平,從而避免因測序深度差異導致的基因檢測數量、基因表達水平的差異。烈冰科技自主研發的單細胞云平臺致力于幫助每一位客戶定制化分析數據,深入解讀數據分析結果,深入挖掘其背后的生物學意義;從操作便捷、結果可視化、分析可追溯、系統穩定等方面助力單細胞研究,加速科研進程!
單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析,可精確地描述每一個細胞的狀態,在異質性發育過程中具有不可忽視的應用價值。然而,單細胞測序無法給出固態異質化組織中細胞空間排布信息,對于揭示發育過程、病理微環境都存在很大的局限性。空間轉錄組測序以點陣形式記錄病理切片細胞的空間信息并進行測序,可以精確指示點陣內的全部基因表達情況。空間轉錄組測序的加入,無疑讓單細胞測序如虎添翼,更精確地勾勒了組織水平的異質性。個性化制定測序項目方面,滿足從檢測基因到蛋白的多組學測序要求。
單細胞測序結果動輒上百G數據量,龐大的數據對于分析平臺和分析能力有著很高的要求,首先針對下機數據的質控環節:單細胞測序產生數億的結果序列,不可避免的會出現低質量的測序結果,存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質量評估就會變得極為重要。序列質量主要通過測序質量值Q20/Q30的占比來表征,即堿基測序結果的錯誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測序結果reads的堿基質量均高于30。保證數據獲得后第一步的處理結果的準確性,為后續細胞類型鑒定準確和功能分析打下堅實基礎。單細胞測序技術提供了單個細胞水平下的科學研究視角。廣州單細胞BCR測序數據分析
國產化PanoCell單細胞測序平臺,提供高性價比服務方案。廣州單細胞BCR測序數據分析
烈冰生物已空間轉錄組測序服務提供從一個組織切片樣本中獲取包括空間信息在內的全部轉錄組數據,從而可以區分和定位功能基因在特定組織區域內的活躍表達。其可以檢測組織樣本中的所有基因活動,并繪制活動發生的位置,這將有助于科學家更好地構建生物圖譜,并進一步理解疾病和生物學過程。目前,空間轉錄組主要應用于多種疾病、免疫、發育、神經和病理學等研究領域。烈冰生物具有專業的實驗團隊、豐富的切片經驗,配置了國際主流的儀器設備,實驗團隊針對不同組織類型優化完善實驗方案,并制定了嚴謹規范的實驗室SOP流程,保證空間轉錄組切片的質量,全優保障測序數據質量。廣州單細胞BCR測序數據分析
上海烈冰生物醫藥科技有限公司擁有生物科技、醫藥科技、信息科技、計算機科技領域內的技術開發、技術服務、技術轉讓、技術咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調查(不得從事社會調查、社會調研、民意調查、民意測驗),從事貨物及技術的進出口業務,計算機、軟件及耗材(除專控),軟件開發【依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動】等多項業務,主營業務涵蓋單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。公司目前擁有較多的高技術人才,以不斷增強企業重點競爭力,加快企業技術創新,實現穩健生產經營。公司業務范圍主要包括:單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序等。公司奉行顧客至上、質量為本的經營宗旨,深受客戶好評。公司深耕單細胞測序,生物大數據云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間、更寬泛的領域拓展。
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