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微生物檢測崗位職責:1.負責產品無菌檢查、微生物限度檢查、細菌內檢查、支原體及外源病毒的分析方法開發、驗證;2.對產品及環境實施無菌檢查、微生物限度檢查、細菌內檢查;3.對原輔料、內包材、工藝用水等實施微生物限度、細菌內檢查;4.對微生物實驗室的試劑、耗材、儀器等實施日常管理;5.對實驗室菌種管理、進行培養基的促生長試驗、無菌試驗的陽性對照試驗;6.進行潔凈區日常環境監控及無菌區人員更衣確認;7.對關鍵檢測數據進行定期的趨勢分析;8.完成上級安排的其他事宜。病原微生物檢測的不可知性使得高通量測序成為研究這類病原微生物的有用工具。隨機PCR微生物篩查方法
微生物鑒定的傳統的鑒定方法雖然仍被普遍使用,但存在兩大缺點。它們只適用于可以體外培養的生物體,而且一些菌株表現出不符合已知種屬模式的獨特的生化特性。許多現代方法并不依賴于活的培養物,它們常常能揭示通過傳統方法檢測不到的有機體之間的細微差別。PCR,包括實時熒光定量PCR,可能是普遍應用于微生物鑒定的分子技術。利用PCR技術,可以快速檢測和鑒定臨床標本的微生物種類,從而加快診斷程序。大多數基于PCR的方法涉及一組通用的PCR引物,通過測序PCR擴增的序列來鑒定細菌/樣品。16SrRNA基因是PCR細菌鑒定的金標準序列,而內部轉錄間隔區(ITS)區域是種類的主要條碼標記。隨機PCR微生物篩查方法病毒研究的發展常常與病毒培養和檢測方法的進步有密切的關系。
傳統的血清學與分子生物學方法如ELISA與PCR,由于病原微生物的特異性差異,有時只能用于病原微生物特定種甚至特定種特定株系分離物的檢測;而電鏡與生物學接種鑒定方法又難以將病原微生物鑒定至物種水平。相比之下,高通量測序技術可以提供一條新的病原微生物鑒定途徑。病原微生物檢測的不可知性使得高通量測序成為研究這類病原微生物的有用工具。目前,該技術在人類與動植物病原微生物的鑒定中已經有較多的應用。高通量測序在臨床virology領域的應用病毒作為一種古老的物種存在于自然界,幾乎能夠在任何物種寄生,與人類健康息息相關。雖然大部分病毒沒有出現明顯的臨床癥狀,少數病毒能夠引起人類多種疾病,表現出包括發熱、腹瀉、出血、出疹、呼吸道癥狀、神經系統癥狀等。
微生物怎么進行檢測?通過顯微鏡直接觀察。一般來說,在一定的培養條件下(相同的培養基、溫度以及培養時間),同種微生物表現出穩定的菌落特征。這些特征包括菌落的形狀、大小、隆起程度和顏色等方面。因此可以通過顯微鏡觀察菌落特征對微生物種類進行判斷。使用選擇培養基培養微生物或人為提供有利于目的菌株生長的條件。選擇培養基,顧名思義其作用是允許特定種類的微生物生長,同時控制或阻止其他微生物生長。例如,使用以尿素作為氮源的培養基能夠培養出可合成脲酶的微生物;在培養基中ph調至酸性有利于霉菌的生長繁殖(控制細菌的生命活動)等。選擇培養一般是通過觀察微生物的同化作用類型或某一特征進行間接判斷,得到的微生物往往并不只有一種,但是能夠大致確定這些微生物存在的共有特征從而對其分類。高通量測序技術問世,給微生物鑒別打開一扇新的大門。
未知病原鑒定測序實驗基于二代測序技術。樣本經過核酸純化-文庫構建-生物信息學分析這3大基本流程后轉換成了病原體的序列數據。首先,在核酸純化環節,探普提供專門針對病原的核酸純化樣本指南,以提高病原純度和得率,與此同時探普生物也提供核酸純化服務。第二,文庫構建環節,探普生物專門針對病原樣本的核酸低濃度/超微總量特點開發了超微量核酸文庫構建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構建成測序文庫。第三,生物信息學分析環節。因為病原一般是在復雜環境或背景中獲得的,因此下機數據一般都伴隨大量的宿主和其他非致病微生物的數據,探普生物基于該特點,優化了自有數據庫,專門針對病原數據搭載了生物信息學分析流程,可處理復雜背景下的病原序列。面對未知病毒,抵抗力是我們健康的屏障。隨機PCR微生物篩查方法
大多微生物鑒定系統采用細菌分解底物后反應液中pH的變化。隨機PCR微生物篩查方法
微生物檢測中含有一種以上的微生物培養物稱為混和培養物。如果在一個菌落中所有細胞均來自于一個親代細胞,那么這個菌落稱為純培養(pureculture)。在進行菌種鑒定時,所用的微生物一般均要求為純的培養物。得到純培養的過程稱為分離純化,方法有許多種。先把微生物懸液通過一系列稀釋,取一定量的稀釋液與熔化好的保持在40-50℃左右的營養瓊脂培養基充分混合,然后把這混合液傾注到無菌的培養皿中,待凝固之后,把這平板倒置在恒箱中培養。單一細胞經過多次增殖后形成一個菌落,取單個菌落制成懸液,重復上述步驟數次,便可得到純培養物。隨機PCR微生物篩查方法
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